建院初期（當年南遷、當年開院）1962年1962年5月，根據黨中央部署，時任農墾部部長王震親自下令，將黑龍江省八五0農場一分為二，南遷三亞建院。10月1日，海南行政公署農墾局第三醫院在海南崖縣（今三亞市）月川村正式建院開業，隸屬于廣東省農墾總局海南農墾局。
1966年5月
1966年5月，醫院由軍代表、醫院革命委員會領導工作。
1969年4月
1969年4月，農墾體制改革，實行軍墾制，醫院改編為“廣州軍區生產建設兵團第三師醫院”，隸屬兵團三師管理。
1974年8月
1974年8月，廣州軍區生產建設兵團第三師醫院改為廣東省海南農墾三亞醫院，歸屬于廣東省農墾總局海南農墾局管理。
1975年9月
1975年9月，醫院定址在三亞鎮解放路（今三亞市解放四路），啟動新院區建設。
1979年5月
1979年5月，農墾體制改革，改名為廣東省通什農墾第一醫院。
1980年12月
1980年12月25日，醫院從月川村舊院址整體搬遷至三亞市區解放四路新址，建筑面積1.39萬平方米。
1985年
1985年，根據廣東省編委（1985）332號文件確定廣東省通什農墾第一醫院為正處級單位。床位502張，定員702人。
1987年
1987年，醫院被國家衛生部評為“全國衛生文化先進單位”，此為醫院第一個國家性榮譽。
1988年5月
1988年5月24日，海南省農墾總局成立，醫院歸屬海南省農墾總局管理，更名為海南省農墾三亞醫院。床位增至604張，工作人員675人。
1989年
1989年，醫院被定為正處級事業單位，定編床位650張，定員900人，系全民所有制單位。
1991年5月
1991年5月，醫院被海南省衛生廳劃定為三級醫院。
1993年9月
1993年9月23日，海南省農墾三亞醫院增掛“海南省第三人民醫院”銜牌和“海南醫學院教學醫院”銜牌。
1994年6月
1994年6月22日，農墾三亞醫院與香港亞洲緊急救援中心簽訂定點醫療救護協議，成為亞援救援中心在海南的首家定點醫院。
1995年8月
1995年8月30日，醫院被國家衛生部、聯合國兒童基金會、世界衛生組織評為“愛嬰醫院”。
1996年10月
1996年10月，醫院通過國家三級甲等醫院評審，成為海南省南部唯一一所三級甲等醫院，醫院發展進入新的里程碑。
1999年1月
1999年1月26日，醫院被國家衛生部指定為“國際緊急救援網絡醫院”。
2006年6月
2006年6月2日，由海南省農墾總局與北京同仁醫療產業集團合資組成海南同仁農墾健康有限公司，醫院更名為海南三亞同仁農墾醫院。
2007年6月
2007年6月28日，醫院回歸海南農墾，恢復海南農墾三亞醫院名稱。
2011年
2011年12月20日，醫院獲“全國文明單位”稱號。
2016年
2016年3月，醫院整體移交海南省衛生和計劃生育委員會，更名為海南省第三人民醫院。8月，我院被海南省衛計委授予海南省危重孕產婦救治中心、海南省危重新生兒救治中心； 9月，海南省衛計委授予我院為省級核輻射應急救治定點醫院。
2017年12月
2017年12月19日，海南省第三人民醫院醫療聯合體成立。
2018年10月
2018年10月31日，醫院正式托管保亭縣人民醫院，開創了海南省內三甲醫院托管省內縣級醫院的先河。
2019年3月
2019年3月4日，醫院正式編制成整建制移交三亞市政府管理，更名為三亞中心醫院（海南省第三人民醫院）。
2019年6月
2019年6月，醫院4個學科獲評省級Ⅰ級臨床重點?？?。
2020年
2020年1月8日，醫院成為湖南醫學院非直屬附屬醫院及臨床學院 。4月，疼痛醫學科被評為海南省級Ⅰ級臨床重點?？?。5月8日，海南省首家實體型“智慧醫院”啟動試運行。6月12日，海南醫學院附屬三亞中心醫院正式掛牌。9月，醫院通過國家衛健委健康信息互聯互通標準化成熟度四級甲等醫院。
2020年
2020年，新冠肺炎疫情突至，作為海南省首批新冠肺炎定點收治醫院和海南危重新冠肺炎患者救治工作定點醫院，1月20日，醫院收治三亞市首位新冠肺炎患者；1月29日，海南省首例確診患者治愈出院；3月8日，三亞市區終于實現了第一批新冠肺炎患者的"清零；醫院共接診103名患者，其中確診：病例58例，成功救治56例，治愈率達96.55%，創造了多項第一，為省、市取得抗擊疫情的階段性成效做出了突出貢獻。
2021年3月
2021年3月23日，醫院天涯醫療集團正式成立。
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